我院司法鉴定中心是经省司法厅2003年9月批准成立，具有以医院党委书记、院长为法人代表的独立机构。2014年9月20日，我院司法鉴定中心通过了云南省司法鉴定机构实验室资质认定计量认证现场评审。该评审的通过在云南省司法鉴定机构中属第二家，地州司法鉴定机构中属第一家，此次评审通过，标志着我院司法鉴定中心迈上了新的台阶。
     实验室认定是目前国际上通行的对检测和校准实验室能力进行评价和正式承认的制度。依据云南省质量技术监督局现场评审计划（2014）认字第200号文指令委派云南省计量院高工汪澄、昆明医科大学副教授赵丽萍，玉溪市质量技术监督局派观察员参加评审。评审组对我院司法鉴定中心机构建立的质量管理体系文件充分性与适应性，申请认可的相关检验标准和具体检验项目的技术能力进行现场考核。同时省质量技术监督局认证认可处、省司法厅司法鉴定管理局、昆明理工大学质量院、云南省质检院，玉溪市质监局、玉溪市司法局等各单位的分管领导10余人参加了评审工作，听取评审专家组组长汪澄同志的现场评价报告，并对我院司法鉴定中心的工作进行了指导。
     评审的通过标志着我院司法鉴定中心具备了符合认证准则要求的管理条件和技术能力，能够客观、公正和独立地从事司法鉴定活动。同时认证结果还将作为行业准入管理、执业监督和行政处罚的依据。对规范我市司法鉴定机构实现合法、科学、有效的管理，进一步建立和完善良好的行业秩序，提升司法鉴定法制化建设和公信力具有积极的意义。
      目前我院司法鉴定中心，现有各类司法鉴定人员17人，工作人员2人，其中法医临床司法鉴定人员8人,主任医师2人,副主任医师2人,主治医师2人，法医2人。鉴定业务范围：法医临床鉴定、法医精神病鉴定、法医病理鉴定、法医物证鉴定和精神障碍医学鉴定。